Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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ASCL3Q9NQ33 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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ASCL3Q9NQ33 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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ASCL3Q9NQ33 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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ASCL3Q9NQ33 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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ASCL3Q9NQ33 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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ASCL3Q9NQ33 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ASCL3Q9NQ33 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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