Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP29Q9HBJ7 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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