Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN6

SLC6A16, Orphan sodium- and chloride-dependent neurotransmitter transporter NTT5, humanhuman

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Length 736 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A16Q9GZN6 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC6A16Q9GZN6 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC6A16Q9GZN6 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC6A16Q9GZN6 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC6A16Q9GZN6 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC6A16Q9GZN6 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 AC108718.1-201ENST00000482382 554 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 CBR3-AS1-213ENST00000623647 815 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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SLC6A16Q9GZN6 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
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SLC6A16Q9GZN6 ITGB5-AS1-201ENST00000495917 460 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
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SLC6A16Q9GZN6 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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SLC6A16Q9GZN6 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A16Q9GZN6 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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