Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K1

SLC39A8, Zinc transporter ZIP8, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A8Q9C0K1 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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