Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
KRTAP2-4Q9BYR9 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
KRTAP2-4Q9BYR9 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
KRTAP2-4Q9BYR9 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
KRTAP2-4Q9BYR9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
KRTAP2-4Q9BYR9 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
KRTAP2-4Q9BYR9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
KRTAP2-4Q9BYR9 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
KRTAP2-4Q9BYR9 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
KRTAP2-4Q9BYR9 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
KRTAP2-4Q9BYR9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
KRTAP2-4Q9BYR9 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
KRTAP2-4Q9BYR9 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
KRTAP2-4Q9BYR9 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
KRTAP2-4Q9BYR9 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
KRTAP2-4Q9BYR9 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
KRTAP2-4Q9BYR9 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
KRTAP2-4Q9BYR9 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
KRTAP2-4Q9BYR9 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
KRTAP2-4Q9BYR9 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
KRTAP2-4Q9BYR9 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
KRTAP2-4Q9BYR9 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
KRTAP2-4Q9BYR9 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
KRTAP2-4Q9BYR9 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
KRTAP2-4Q9BYR9 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
KRTAP2-4Q9BYR9 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
KRTAP2-4Q9BYR9 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
KRTAP2-4Q9BYR9 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
KRTAP2-4Q9BYR9 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
KRTAP2-4Q9BYR9 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
KRTAP2-4Q9BYR9 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
KRTAP2-4Q9BYR9 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
KRTAP2-4Q9BYR9 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
KRTAP2-4Q9BYR9 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
KRTAP2-4Q9BYR9 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
KRTAP2-4Q9BYR9 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
KRTAP2-4Q9BYR9 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
KRTAP2-4Q9BYR9 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
KRTAP2-4Q9BYR9 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
KRTAP2-4Q9BYR9 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.49
KRTAP2-4Q9BYR9 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
KRTAP2-4Q9BYR9 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
KRTAP2-4Q9BYR9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
KRTAP2-4Q9BYR9 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 PRDX2-202ENST00000334482 784 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 CRCT1-201ENST00000368790 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AC011997.1-201ENST00000409845 1032 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 RRNAD1-204ENST00000476229 1096 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 ARL17B-207ENST00000575960 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KRTAP2-4Q9BYR9 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms