Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF17Q9BXT8 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms