Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms