Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms