Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms