Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms