Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAMP1Q96JM3 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms