Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms