Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms