Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms