Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RB1CC1Q8TDY2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RB1CC1Q8TDY2 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RB1CC1Q8TDY2 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RB1CC1Q8TDY2 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RB1CC1Q8TDY2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms