Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBU5

ATAD1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD1Q8NBU5 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATAD1Q8NBU5 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms