Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms