Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD35Q8N283 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD35Q8N283 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD35Q8N283 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD35Q8N283 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD35Q8N283 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD35Q8N283 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD35Q8N283 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD35Q8N283 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD35Q8N283 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD35Q8N283 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD35Q8N283 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD35Q8N283 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD35Q8N283 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD35Q8N283 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD35Q8N283 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD35Q8N283 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD35Q8N283 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD35Q8N283 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD35Q8N283 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD35Q8N283 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD35Q8N283 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD35Q8N283 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD35Q8N283 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD35Q8N283 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD35Q8N283 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD35Q8N283 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD35Q8N283 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD35Q8N283 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD35Q8N283 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD35Q8N283 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD35Q8N283 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms