Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNE4Q8N205 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNE4Q8N205 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SYNE4Q8N205 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SYNE4Q8N205 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SYNE4Q8N205 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SYNE4Q8N205 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SYNE4Q8N205 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNE4Q8N205 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms