Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms