Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms