Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms