Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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