Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms