Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms