Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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