Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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GEN1Q17RS7 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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GEN1Q17RS7 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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GEN1Q17RS7 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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GEN1Q17RS7 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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GEN1Q17RS7 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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GEN1Q17RS7 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GEN1Q17RS7 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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