Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
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CCDC142Q17RM4 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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