Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRNQ16849 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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PTPRNQ16849 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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PTPRNQ16849 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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PTPRNQ16849 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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PTPRNQ16849 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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PTPRNQ16849 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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