Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms