Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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