Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HIST3H3Q16695 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms