Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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