Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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