Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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