Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX3Q13761 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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