Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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CUL3Q13618 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CUL3Q13618 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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