Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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