Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

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Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTMR3Q13615 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms