Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
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