Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE3BQ13370 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE3BQ13370 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE3BQ13370 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE3BQ13370 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE3BQ13370 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE3BQ13370 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PDE3BQ13370 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE3BQ13370 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE3BQ13370 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PDE3BQ13370 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE3BQ13370 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE3BQ13370 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE3BQ13370 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE3BQ13370 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PDE3BQ13370 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE3BQ13370 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE3BQ13370 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE3BQ13370 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE3BQ13370 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE3BQ13370 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE3BQ13370 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE3BQ13370 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE3BQ13370 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE3BQ13370 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE3BQ13370 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE3BQ13370 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE3BQ13370 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE3BQ13370 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE3BQ13370 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE3BQ13370 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE3BQ13370 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE3BQ13370 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE3BQ13370 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE3BQ13370 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE3BQ13370 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE3BQ13370 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE3BQ13370 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE3BQ13370 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE3BQ13370 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE3BQ13370 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE3BQ13370 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE3BQ13370 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE3BQ13370 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE3BQ13370 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE3BQ13370 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE3BQ13370 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE3BQ13370 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE3BQ13370 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE3BQ13370 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE3BQ13370 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE3BQ13370 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE3BQ13370 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE3BQ13370 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE3BQ13370 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE3BQ13370 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE3BQ13370 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE3BQ13370 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE3BQ13370 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE3BQ13370 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE3BQ13370 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE3BQ13370 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE3BQ13370 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE3BQ13370 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE3BQ13370 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE3BQ13370 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PDE3BQ13370 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE3BQ13370 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE3BQ13370 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE3BQ13370 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE3BQ13370 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PDE3BQ13370 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE3BQ13370 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE3BQ13370 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE3BQ13370 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE3BQ13370 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE3BQ13370 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE3BQ13370 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE3BQ13370 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE3BQ13370 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE3BQ13370 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE3BQ13370 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE3BQ13370 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE3BQ13370 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE3BQ13370 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE3BQ13370 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE3BQ13370 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE3BQ13370 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE3BQ13370 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE3BQ13370 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE3BQ13370 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE3BQ13370 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE3BQ13370 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE3BQ13370 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE3BQ13370 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE3BQ13370 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE3BQ13370 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE3BQ13370 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE3BQ13370 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE3BQ13370 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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