Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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CHAF1BQ13112 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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CHAF1BQ13112 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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CHAF1BQ13112 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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CHAF1BQ13112 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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CHAF1BQ13112 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHAF1BQ13112 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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