Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms