Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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