Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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PTPN13Q12923 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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PTPN13Q12923 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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PTPN13Q12923 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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PTPN13Q12923 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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