Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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CNTN1Q12860 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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