Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIAQ12857 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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