Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFCP2Q12800 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms