Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms