Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TGM3Q08188 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TGM3Q08188 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TGM3Q08188 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TGM3Q08188 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TGM3Q08188 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TGM3Q08188 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TGM3Q08188 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TGM3Q08188 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TGM3Q08188 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TGM3Q08188 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TGM3Q08188 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TGM3Q08188 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TGM3Q08188 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TGM3Q08188 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TGM3Q08188 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TGM3Q08188 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TGM3Q08188 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TGM3Q08188 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TGM3Q08188 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TGM3Q08188 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TGM3Q08188 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TGM3Q08188 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TGM3Q08188 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TGM3Q08188 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TGM3Q08188 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TGM3Q08188 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TGM3Q08188 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TGM3Q08188 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TGM3Q08188 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TGM3Q08188 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TGM3Q08188 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TGM3Q08188 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TGM3Q08188 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TGM3Q08188 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TGM3Q08188 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TGM3Q08188 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TGM3Q08188 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TGM3Q08188 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TGM3Q08188 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TGM3Q08188 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TGM3Q08188 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TGM3Q08188 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TGM3Q08188 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TGM3Q08188 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TGM3Q08188 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TGM3Q08188 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TGM3Q08188 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TGM3Q08188 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TGM3Q08188 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TGM3Q08188 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TGM3Q08188 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TGM3Q08188 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TGM3Q08188 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TGM3Q08188 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TGM3Q08188 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TGM3Q08188 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TGM3Q08188 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TGM3Q08188 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TGM3Q08188 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TGM3Q08188 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TGM3Q08188 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TGM3Q08188 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TGM3Q08188 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TGM3Q08188 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TGM3Q08188 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TGM3Q08188 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TGM3Q08188 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TGM3Q08188 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TGM3Q08188 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TGM3Q08188 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TGM3Q08188 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TGM3Q08188 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TGM3Q08188 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TGM3Q08188 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TGM3Q08188 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TGM3Q08188 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TGM3Q08188 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TGM3Q08188 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TGM3Q08188 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TGM3Q08188 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGM3Q08188 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGM3Q08188 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGM3Q08188 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TGM3Q08188 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGM3Q08188 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TGM3Q08188 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TGM3Q08188 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGM3Q08188 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TGM3Q08188 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TGM3Q08188 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGM3Q08188 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGM3Q08188 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGM3Q08188 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGM3Q08188 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGM3Q08188 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGM3Q08188 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGM3Q08188 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TGM3Q08188 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGM3Q08188 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms